Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD3O95983 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD3O95983 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD3O95983 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MBD3O95983 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD3O95983 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MBD3O95983 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms