Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYF2O95926 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYF2O95926 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYF2O95926 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYF2O95926 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYF2O95926 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYF2O95926 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYF2O95926 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYF2O95926 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYF2O95926 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYF2O95926 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYF2O95926 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYF2O95926 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYF2O95926 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYF2O95926 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYF2O95926 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYF2O95926 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYF2O95926 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYF2O95926 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms