Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM4AO75164 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms