Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX5O60225 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX5O60225 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX5O60225 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX5O60225 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX5O60225 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX5O60225 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX5O60225 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX5O60225 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSX5O60225 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSX5O60225 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSX5O60225 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSX5O60225 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SSX5O60225 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSX5O60225 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSX5O60225 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSX5O60225 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSX5O60225 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSX5O60225 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSX5O60225 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSX5O60225 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSX5O60225 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms