Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRAC1Q96KF2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms