Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMARCE1Q969G3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms