Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms