Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX1Q16384 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSX1Q16384 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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