Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8Q15843 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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