Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM3BP58499 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3BP58499 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM3BP58499 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3BP58499 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms