Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC34P49427 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC34P49427 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC34P49427 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC34P49427 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC34P49427 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC34P49427 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC34P49427 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC34P49427 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC34P49427 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms