Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms