Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN8O00124 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms