Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
THUMPD3Q9BV44 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
THUMPD3Q9BV44 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms