Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CHCHD5Q9BSY4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHCHD5Q9BSY4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms