Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOFQ13790 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOFQ13790 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOFQ13790 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOFQ13790 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOFQ13790 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOFQ13790 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOFQ13790 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOFQ13790 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOFQ13790 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOFQ13790 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOFQ13790 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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