Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ERCC8Q13216 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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