Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOSBP53539 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOSBP53539 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOSBP53539 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOSBP53539 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSBP53539 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSBP53539 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSBP53539 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSBP53539 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSBP53539 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSBP53539 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSBP53539 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSBP53539 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSBP53539 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSBP53539 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSBP53539 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSBP53539 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSBP53539 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSBP53539 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSBP53539 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSBP53539 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOSBP53539 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOSBP53539 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms