Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms