Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP4P12644 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP4P12644 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP4P12644 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP4P12644 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP4P12644 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP4P12644 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMP4P12644 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMP4P12644 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMP4P12644 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMP4P12644 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BMP4P12644 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BMP4P12644 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BMP4P12644 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BMP4P12644 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BMP4P12644 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BMP4P12644 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BMP4P12644 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BMP4P12644 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms