Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNAB3O43448 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNAB3O43448 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms