Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6L3A6NEY3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms