Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms