Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms