Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6P435 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6P435 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6P435 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6P435 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms