Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PXDC1Q5TGL8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms