Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ANKRD39Q53RE8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms