Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRS3P32247 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRS3P32247 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BRS3P32247 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BRS3P32247 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BRS3P32247 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms