Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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