Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT3AQ9Y6K1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNMT3AQ9Y6K1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNMT3AQ9Y6K1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNMT3AQ9Y6K1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT3AQ9Y6K1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT3AQ9Y6K1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT3AQ9Y6K1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT3AQ9Y6K1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT3AQ9Y6K1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT3AQ9Y6K1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3AQ9Y6K1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3AQ9Y6K1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT3AQ9Y6K1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT3AQ9Y6K1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT3AQ9Y6K1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNMT3AQ9Y6K1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNMT3AQ9Y6K1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms