Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ARFGEF2Q9Y6D5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
ARFGEF2Q9Y6D5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARFGEF2Q9Y6D5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARFGEF2Q9Y6D5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARFGEF2Q9Y6D5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARFGEF2Q9Y6D5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARFGEF2Q9Y6D5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARFGEF2Q9Y6D5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARFGEF2Q9Y6D5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARFGEF2Q9Y6D5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARFGEF2Q9Y6D5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARFGEF2Q9Y6D5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
ARFGEF2Q9Y6D5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARFGEF2Q9Y6D5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARFGEF2Q9Y6D5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
ARFGEF2Q9Y6D5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARFGEF2Q9Y6D5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARFGEF2Q9Y6D5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARFGEF2Q9Y6D5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARFGEF2Q9Y6D5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARFGEF2Q9Y6D5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARFGEF2Q9Y6D5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARFGEF2Q9Y6D5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARFGEF2Q9Y6D5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARFGEF2Q9Y6D5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARFGEF2Q9Y6D5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARFGEF2Q9Y6D5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARFGEF2Q9Y6D5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARFGEF2Q9Y6D5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARFGEF2Q9Y6D5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARFGEF2Q9Y6D5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARFGEF2Q9Y6D5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARFGEF2Q9Y6D5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARFGEF2Q9Y6D5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARFGEF2Q9Y6D5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARFGEF2Q9Y6D5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARFGEF2Q9Y6D5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARFGEF2Q9Y6D5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARFGEF2Q9Y6D5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARFGEF2Q9Y6D5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARFGEF2Q9Y6D5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARFGEF2Q9Y6D5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARFGEF2Q9Y6D5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARFGEF2Q9Y6D5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARFGEF2Q9Y6D5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARFGEF2Q9Y6D5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARFGEF2Q9Y6D5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARFGEF2Q9Y6D5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ARFGEF2Q9Y6D5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ARFGEF2Q9Y6D5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ARFGEF2Q9Y6D5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARFGEF2Q9Y6D5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ARFGEF2Q9Y6D5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms