Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
DCAF1Q9Y4B6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.47■■■■■ 5.67
DCAF1Q9Y4B6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC50.47■■■■■ 5.67
DCAF1Q9Y4B6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC50.46■■■■■ 5.67
DCAF1Q9Y4B6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC50.45■■■■■ 5.67
DCAF1Q9Y4B6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC50.45■■■■■ 5.67
DCAF1Q9Y4B6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC50.45■■■■■ 5.67
DCAF1Q9Y4B6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.44■■■■■ 5.67
DCAF1Q9Y4B6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.44■■■■■ 5.67
DCAF1Q9Y4B6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.44■■■■■ 5.67
DCAF1Q9Y4B6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
DCAF1Q9Y4B6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
DCAF1Q9Y4B6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC50.42■■■■■ 5.66
DCAF1Q9Y4B6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC50.42■■■■■ 5.66
DCAF1Q9Y4B6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
DCAF1Q9Y4B6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC50.4■■■■■ 5.66
DCAF1Q9Y4B6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC50.4■■■■■ 5.66
DCAF1Q9Y4B6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC50.4■■■■■ 5.66
DCAF1Q9Y4B6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.39■■■■■ 5.66
DCAF1Q9Y4B6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.39■■■■■ 5.66
DCAF1Q9Y4B6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
DCAF1Q9Y4B6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
DCAF1Q9Y4B6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.36■■■■■ 5.65
DCAF1Q9Y4B6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC50.36■■■■■ 5.65
DCAF1Q9Y4B6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC50.35■■■■■ 5.65
DCAF1Q9Y4B6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.35■■■■■ 5.65
DCAF1Q9Y4B6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
DCAF1Q9Y4B6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.31■■■■■ 5.65
DCAF1Q9Y4B6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.64
DCAF1Q9Y4B6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC50.31■■■■■ 5.64
DCAF1Q9Y4B6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC50.31■■■■■ 5.64
DCAF1Q9Y4B6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC50.31■■■■■ 5.64
DCAF1Q9Y4B6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.64
DCAF1Q9Y4B6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.29■■■■■ 5.64
DCAF1Q9Y4B6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC50.29■■■■■ 5.64
DCAF1Q9Y4B6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.28■■■■■ 5.64
DCAF1Q9Y4B6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.28■■■■■ 5.64
DCAF1Q9Y4B6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
DCAF1Q9Y4B6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC50.24■■■■■ 5.63
DCAF1Q9Y4B6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC50.23■■■■■ 5.63
DCAF1Q9Y4B6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
DCAF1Q9Y4B6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
DCAF1Q9Y4B6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC50.22■■■■■ 5.63
DCAF1Q9Y4B6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC50.21■■■■■ 5.63
DCAF1Q9Y4B6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.21■■■■■ 5.63
DCAF1Q9Y4B6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.21■■■■■ 5.63
DCAF1Q9Y4B6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC50.21■■■■■ 5.63
DCAF1Q9Y4B6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
DCAF1Q9Y4B6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
DCAF1Q9Y4B6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.63
DCAF1Q9Y4B6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.62
DCAF1Q9Y4B6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC50.19■■■■■ 5.62
DCAF1Q9Y4B6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
DCAF1Q9Y4B6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC50.18■■■■■ 5.62
DCAF1Q9Y4B6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC50.18■■■■■ 5.62
DCAF1Q9Y4B6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC50.17■■■■■ 5.62
DCAF1Q9Y4B6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC50.16■■■■■ 5.62
DCAF1Q9Y4B6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
DCAF1Q9Y4B6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC50.16■■■■■ 5.62
DCAF1Q9Y4B6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
DCAF1Q9Y4B6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
DCAF1Q9Y4B6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.15■■■■■ 5.62
DCAF1Q9Y4B6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
DCAF1Q9Y4B6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.14■■■■■ 5.62
DCAF1Q9Y4B6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
DCAF1Q9Y4B6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC50.13■■■■■ 5.62
DCAF1Q9Y4B6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
DCAF1Q9Y4B6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC50.12■■■■■ 5.61
DCAF1Q9Y4B6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
DCAF1Q9Y4B6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
DCAF1Q9Y4B6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.1■■■■■ 5.61
DCAF1Q9Y4B6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC50.1■■■■■ 5.61
DCAF1Q9Y4B6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC50.09■■■■■ 5.61
DCAF1Q9Y4B6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.09■■■■■ 5.61
DCAF1Q9Y4B6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.09■■■■■ 5.61
DCAF1Q9Y4B6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC50.09■■■■■ 5.61
DCAF1Q9Y4B6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.09■■■■■ 5.61
DCAF1Q9Y4B6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.6
DCAF1Q9Y4B6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC50.06■■■■■ 5.6
DCAF1Q9Y4B6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
DCAF1Q9Y4B6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.05■■■■■ 5.6
DCAF1Q9Y4B6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
DCAF1Q9Y4B6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC50.04■■■■■ 5.6
DCAF1Q9Y4B6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
DCAF1Q9Y4B6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
DCAF1Q9Y4B6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC50.03■■■■■ 5.6
DCAF1Q9Y4B6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
DCAF1Q9Y4B6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
DCAF1Q9Y4B6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
DCAF1Q9Y4B6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
DCAF1Q9Y4B6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC49.99■■■■■ 5.59
DCAF1Q9Y4B6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC49.99■■■■■ 5.59
DCAF1Q9Y4B6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
DCAF1Q9Y4B6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC49.98■■■■■ 5.59
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC49.98■■■■■ 5.59
DCAF1Q9Y4B6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC49.97■■■■■ 5.59
DCAF1Q9Y4B6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.97■■■■■ 5.59
DCAF1Q9Y4B6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.95■■■■■ 5.59
DCAF1Q9Y4B6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
DCAF1Q9Y4B6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC49.93■■■■■ 5.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms