Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHTOPQ9Y3Y2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms