Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SF3B6Q9Y3B4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SF3B6Q9Y3B4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SF3B6Q9Y3B4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SF3B6Q9Y3B4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SF3B6Q9Y3B4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms