Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM2AQ9Y2K7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM2AQ9Y2K7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
KDM2AQ9Y2K7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
KDM2AQ9Y2K7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
KDM2AQ9Y2K7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
KDM2AQ9Y2K7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
KDM2AQ9Y2K7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
KDM2AQ9Y2K7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
KDM2AQ9Y2K7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM2AQ9Y2K7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
KDM2AQ9Y2K7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM2AQ9Y2K7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM2AQ9Y2K7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM2AQ9Y2K7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KDM2AQ9Y2K7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
KDM2AQ9Y2K7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM2AQ9Y2K7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
KDM2AQ9Y2K7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
KDM2AQ9Y2K7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM2AQ9Y2K7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM2AQ9Y2K7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM2AQ9Y2K7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
KDM2AQ9Y2K7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
KDM2AQ9Y2K7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
KDM2AQ9Y2K7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM2AQ9Y2K7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM2AQ9Y2K7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM2AQ9Y2K7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM2AQ9Y2K7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM2AQ9Y2K7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM2AQ9Y2K7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM2AQ9Y2K7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM2AQ9Y2K7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM2AQ9Y2K7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM2AQ9Y2K7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM2AQ9Y2K7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM2AQ9Y2K7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM2AQ9Y2K7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM2AQ9Y2K7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
KDM2AQ9Y2K7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms