Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NOD1Q9Y239 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOD1Q9Y239 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOD1Q9Y239 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NOD1Q9Y239 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOD1Q9Y239 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOD1Q9Y239 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NOD1Q9Y239 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOD1Q9Y239 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOD1Q9Y239 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOD1Q9Y239 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOD1Q9Y239 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
NOD1Q9Y239 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOD1Q9Y239 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOD1Q9Y239 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOD1Q9Y239 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOD1Q9Y239 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOD1Q9Y239 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOD1Q9Y239 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOD1Q9Y239 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOD1Q9Y239 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOD1Q9Y239 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOD1Q9Y239 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOD1Q9Y239 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOD1Q9Y239 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOD1Q9Y239 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOD1Q9Y239 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOD1Q9Y239 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOD1Q9Y239 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NOD1Q9Y239 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NOD1Q9Y239 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOD1Q9Y239 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOD1Q9Y239 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOD1Q9Y239 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOD1Q9Y239 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NOD1Q9Y239 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOD1Q9Y239 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOD1Q9Y239 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOD1Q9Y239 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOD1Q9Y239 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOD1Q9Y239 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOD1Q9Y239 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOD1Q9Y239 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOD1Q9Y239 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOD1Q9Y239 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NOD1Q9Y239 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOD1Q9Y239 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NOD1Q9Y239 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOD1Q9Y239 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOD1Q9Y239 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOD1Q9Y239 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOD1Q9Y239 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOD1Q9Y239 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOD1Q9Y239 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NOD1Q9Y239 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NOD1Q9Y239 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NOD1Q9Y239 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOD1Q9Y239 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOD1Q9Y239 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NOD1Q9Y239 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NOD1Q9Y239 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms