Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AGAP1Q9UPQ3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AGAP1Q9UPQ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AGAP1Q9UPQ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AGAP1Q9UPQ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AGAP1Q9UPQ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
AGAP1Q9UPQ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AGAP1Q9UPQ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AGAP1Q9UPQ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AGAP1Q9UPQ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AGAP1Q9UPQ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
AGAP1Q9UPQ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AGAP1Q9UPQ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.57■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.57■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.55■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms