Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM33Q9UPN9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM33Q9UPN9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM33Q9UPN9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms