Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SNX12Q9UMY4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SNX12Q9UMY4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX12Q9UMY4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX12Q9UMY4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX12Q9UMY4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX12Q9UMY4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX12Q9UMY4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX12Q9UMY4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX12Q9UMY4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX12Q9UMY4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX12Q9UMY4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX12Q9UMY4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX12Q9UMY4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX12Q9UMY4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX12Q9UMY4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX12Q9UMY4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX12Q9UMY4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX12Q9UMY4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX12Q9UMY4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms