Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCO1Q9UM00 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCO1Q9UM00 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO1Q9UM00 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO1Q9UM00 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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