Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CIZ1Q9ULV3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CIZ1Q9ULV3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CIZ1Q9ULV3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CIZ1Q9ULV3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CIZ1Q9ULV3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CIZ1Q9ULV3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CIZ1Q9ULV3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CIZ1Q9ULV3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CIZ1Q9ULV3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CIZ1Q9ULV3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CIZ1Q9ULV3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CIZ1Q9ULV3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CIZ1Q9ULV3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CIZ1Q9ULV3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CIZ1Q9ULV3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CIZ1Q9ULV3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CIZ1Q9ULV3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CIZ1Q9ULV3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CIZ1Q9ULV3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CIZ1Q9ULV3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CIZ1Q9ULV3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CIZ1Q9ULV3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CIZ1Q9ULV3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CIZ1Q9ULV3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CIZ1Q9ULV3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CIZ1Q9ULV3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CIZ1Q9ULV3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CIZ1Q9ULV3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CIZ1Q9ULV3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CIZ1Q9ULV3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CIZ1Q9ULV3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CIZ1Q9ULV3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CIZ1Q9ULV3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CIZ1Q9ULV3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms