Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV0

MYO5B, Unconventional myosin-Vb, humanhuman

Predictions only

Length 1,848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5BQ9ULV0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
MYO5BQ9ULV0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
MYO5BQ9ULV0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
MYO5BQ9ULV0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
MYO5BQ9ULV0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
MYO5BQ9ULV0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
MYO5BQ9ULV0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
MYO5BQ9ULV0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
MYO5BQ9ULV0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
MYO5BQ9ULV0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
MYO5BQ9ULV0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
MYO5BQ9ULV0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
MYO5BQ9ULV0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
MYO5BQ9ULV0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
MYO5BQ9ULV0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
MYO5BQ9ULV0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
MYO5BQ9ULV0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
MYO5BQ9ULV0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
MYO5BQ9ULV0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
MYO5BQ9ULV0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
MYO5BQ9ULV0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
MYO5BQ9ULV0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
MYO5BQ9ULV0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
MYO5BQ9ULV0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
MYO5BQ9ULV0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
MYO5BQ9ULV0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.38■■■■□ 3.58
MYO5BQ9ULV0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
MYO5BQ9ULV0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
MYO5BQ9ULV0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
MYO5BQ9ULV0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
MYO5BQ9ULV0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
MYO5BQ9ULV0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
MYO5BQ9ULV0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
MYO5BQ9ULV0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
MYO5BQ9ULV0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
MYO5BQ9ULV0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
MYO5BQ9ULV0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
MYO5BQ9ULV0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
MYO5BQ9ULV0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
MYO5BQ9ULV0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
MYO5BQ9ULV0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
MYO5BQ9ULV0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
MYO5BQ9ULV0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
MYO5BQ9ULV0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
MYO5BQ9ULV0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
MYO5BQ9ULV0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
MYO5BQ9ULV0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
MYO5BQ9ULV0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
MYO5BQ9ULV0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
MYO5BQ9ULV0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
MYO5BQ9ULV0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
MYO5BQ9ULV0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
MYO5BQ9ULV0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
MYO5BQ9ULV0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
MYO5BQ9ULV0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
MYO5BQ9ULV0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
MYO5BQ9ULV0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
MYO5BQ9ULV0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
MYO5BQ9ULV0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
MYO5BQ9ULV0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
MYO5BQ9ULV0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
MYO5BQ9ULV0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
MYO5BQ9ULV0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
MYO5BQ9ULV0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms