Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RARRES3Q9UL19 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARRES3Q9UL19 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARRES3Q9UL19 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARRES3Q9UL19 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms