Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATPIF1Q9UII2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATPIF1Q9UII2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATPIF1Q9UII2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms