Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP25Q9UHP3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP25Q9UHP3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP25Q9UHP3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP25Q9UHP3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
USP25Q9UHP3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP25Q9UHP3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP25Q9UHP3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP25Q9UHP3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP25Q9UHP3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP25Q9UHP3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP25Q9UHP3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP25Q9UHP3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP25Q9UHP3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP25Q9UHP3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP25Q9UHP3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP25Q9UHP3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP25Q9UHP3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP25Q9UHP3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP25Q9UHP3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP25Q9UHP3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP25Q9UHP3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP25Q9UHP3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms