Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ABCF2Q9UG63 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ABCF2Q9UG63 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ABCF2Q9UG63 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ABCF2Q9UG63 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ABCF2Q9UG63 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ABCF2Q9UG63 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ABCF2Q9UG63 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ABCF2Q9UG63 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ABCF2Q9UG63 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ABCF2Q9UG63 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ABCF2Q9UG63 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ABCF2Q9UG63 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ABCF2Q9UG63 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ABCF2Q9UG63 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
ABCF2Q9UG63 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ABCF2Q9UG63 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ABCF2Q9UG63 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
ABCF2Q9UG63 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCF2Q9UG63 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ABCF2Q9UG63 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ABCF2Q9UG63 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCF2Q9UG63 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCF2Q9UG63 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCF2Q9UG63 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCF2Q9UG63 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCF2Q9UG63 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCF2Q9UG63 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCF2Q9UG63 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms