Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLKQ9UBT6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLKQ9UBT6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
POLKQ9UBT6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLKQ9UBT6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
POLKQ9UBT6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
POLKQ9UBT6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
POLKQ9UBT6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
POLKQ9UBT6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
POLKQ9UBT6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
POLKQ9UBT6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
POLKQ9UBT6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
POLKQ9UBT6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
POLKQ9UBT6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
POLKQ9UBT6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
POLKQ9UBT6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
POLKQ9UBT6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
POLKQ9UBT6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
POLKQ9UBT6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
POLKQ9UBT6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
POLKQ9UBT6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
POLKQ9UBT6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
POLKQ9UBT6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
POLKQ9UBT6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
POLKQ9UBT6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
POLKQ9UBT6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
POLKQ9UBT6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
POLKQ9UBT6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
POLKQ9UBT6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
POLKQ9UBT6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
POLKQ9UBT6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
POLKQ9UBT6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
POLKQ9UBT6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
POLKQ9UBT6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
POLKQ9UBT6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
POLKQ9UBT6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
POLKQ9UBT6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
POLKQ9UBT6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
POLKQ9UBT6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
POLKQ9UBT6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
POLKQ9UBT6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
POLKQ9UBT6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
POLKQ9UBT6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
POLKQ9UBT6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
POLKQ9UBT6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
POLKQ9UBT6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
POLKQ9UBT6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
POLKQ9UBT6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1167.1 ms