Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS4

DNAJB11, DnaJ homolog subfamily B member 11, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11Q9UBS4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJB11Q9UBS4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DNAJB11Q9UBS4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJB11Q9UBS4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms