Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHMP5Q9NZZ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHMP5Q9NZZ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHMP5Q9NZZ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHMP5Q9NZZ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHMP5Q9NZZ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHMP5Q9NZZ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHMP5Q9NZZ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHMP5Q9NZZ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHMP5Q9NZZ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHMP5Q9NZZ3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHMP5Q9NZZ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHMP5Q9NZZ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHMP5Q9NZZ3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHMP5Q9NZZ3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHMP5Q9NZZ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHMP5Q9NZZ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHMP5Q9NZZ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHMP5Q9NZZ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHMP5Q9NZZ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHMP5Q9NZZ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHMP5Q9NZZ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHMP5Q9NZZ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHMP5Q9NZZ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHMP5Q9NZZ3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHMP5Q9NZZ3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHMP5Q9NZZ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHMP5Q9NZZ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHMP5Q9NZZ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHMP5Q9NZZ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHMP5Q9NZZ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHMP5Q9NZZ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHMP5Q9NZZ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHMP5Q9NZZ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHMP5Q9NZZ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHMP5Q9NZZ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHMP5Q9NZZ3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHMP5Q9NZZ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHMP5Q9NZZ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHMP5Q9NZZ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHMP5Q9NZZ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHMP5Q9NZZ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHMP5Q9NZZ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
CHMP5Q9NZZ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHMP5Q9NZZ3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHMP5Q9NZZ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHMP5Q9NZZ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHMP5Q9NZZ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHMP5Q9NZZ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHMP5Q9NZZ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHMP5Q9NZZ3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHMP5Q9NZZ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHMP5Q9NZZ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHMP5Q9NZZ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHMP5Q9NZZ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHMP5Q9NZZ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHMP5Q9NZZ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHMP5Q9NZZ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CHMP5Q9NZZ3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
CHMP5Q9NZZ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CHMP5Q9NZZ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHMP5Q9NZZ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHMP5Q9NZZ3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHMP5Q9NZZ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHMP5Q9NZZ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CHMP5Q9NZZ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHMP5Q9NZZ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHMP5Q9NZZ3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHMP5Q9NZZ3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHMP5Q9NZZ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms