Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOR4AQ9NXH8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOR4AQ9NXH8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOR4AQ9NXH8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOR4AQ9NXH8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOR4AQ9NXH8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOR4AQ9NXH8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOR4AQ9NXH8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOR4AQ9NXH8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOR4AQ9NXH8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOR4AQ9NXH8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOR4AQ9NXH8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOR4AQ9NXH8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOR4AQ9NXH8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOR4AQ9NXH8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms